Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTRT3Q9BYD9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms