Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms