Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms