Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPOQ9BU64 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPOQ9BU64 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms