Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TINF2Q9BSI4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms