Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms