Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms