Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms