Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CICQ96RK0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms