Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB3IPQ96QF0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB3IPQ96QF0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB3IPQ96QF0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB3IPQ96QF0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB3IPQ96QF0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB3IPQ96QF0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB3IPQ96QF0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB3IPQ96QF0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3IPQ96QF0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3IPQ96QF0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3IPQ96QF0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3IPQ96QF0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3IPQ96QF0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3IPQ96QF0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3IPQ96QF0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3IPQ96QF0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3IPQ96QF0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3IPQ96QF0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3IPQ96QF0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3IPQ96QF0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3IPQ96QF0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms