Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms