Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OPALINQ96PE5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121 ms