Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms