Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms