Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms