Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms