Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms