Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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RNF183Q96D59 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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RNF183Q96D59 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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RNF183Q96D59 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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RNF183Q96D59 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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RNF183Q96D59 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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RNF183Q96D59 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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RNF183Q96D59 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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