Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT7

CCDC124, Coiled-coil domain-containing protein 124, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC124Q96CT7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC124Q96CT7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC124Q96CT7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC124Q96CT7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC124Q96CT7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC124Q96CT7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC124Q96CT7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC124Q96CT7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC124Q96CT7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC124Q96CT7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC124Q96CT7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC124Q96CT7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC124Q96CT7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC124Q96CT7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC124Q96CT7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC124Q96CT7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC124Q96CT7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC124Q96CT7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms