Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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