Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ULK4Q96C45 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms