Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms