Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms