Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms