Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms