Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms