Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms