Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms