Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms