Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCX0

CCDC150, Coiled-coil domain-containing protein 150, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC150Q8NCX0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC150Q8NCX0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms