Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms