Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms