Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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