Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC71Q8IV32 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC71Q8IV32 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC71Q8IV32 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC71Q8IV32 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC71Q8IV32 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC71Q8IV32 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC71Q8IV32 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC71Q8IV32 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC71Q8IV32 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC71Q8IV32 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC71Q8IV32 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC71Q8IV32 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC71Q8IV32 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC71Q8IV32 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC71Q8IV32 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC71Q8IV32 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC71Q8IV32 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC71Q8IV32 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC71Q8IV32 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms