Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLD3Q8IV08 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms