Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HAPLN4Q86UW8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms