Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG4DQ86TL0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms