Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms