Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms