Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC80Q76M96 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms