Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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