Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms