Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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