Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms