Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms