Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms