Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCSAPQ6IQ19 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms