Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC102BQ68D86 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC102BQ68D86 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC102BQ68D86 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC102BQ68D86 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC102BQ68D86 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC102BQ68D86 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC102BQ68D86 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC102BQ68D86 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC102BQ68D86 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC102BQ68D86 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC102BQ68D86 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC102BQ68D86 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC102BQ68D86 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC102BQ68D86 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC102BQ68D86 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC102BQ68D86 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC102BQ68D86 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC102BQ68D86 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC102BQ68D86 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms