Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CLQ60I27 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms