Protein–RNA interactions for Protein: Q5ZPR3

CD276, CD276 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD276Q5ZPR3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD276Q5ZPR3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms